报告人:梁丽萍
报告题目:一种新的DNA序列进化距离及其应用
报告时间:2010年9月19日上午10:00-11:00
报告地点:72886必赢二楼会议室
摘要:DNA是遗传基因的载体物质,DNA分子中的核苷酸变异是基因进化的原动力。为了研究核苷酸变异,通过DNA序列的非替代结果,建立了DNA序列进化的动力学方程,进而得到了一种新的物种间进化距离dy(选择模型)。由于核苷酸替代模型有很多,选用其中的五种模型,计算出其相应的进化距离dy,该进化距离包含了五种模型下的p距离、替代率为常数的距离d和替代率服从Г分布的距离dG。进一步对动力学参数b的性质进行研究分析,并根据动力学方程的特点,将模型转化为一元线性回归问题,用最小二乘法求得选择模型中的动力学参数b和各核苷酸位点每年的平均替代速率r。以16个物种的线粒体基因序列为例,来说明以上提出的方法。
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二零一零年九月十八日